Een team van Britse en Canadese onderzoekers is erin geslaagd om met succes het volledige genoom van een levend organisme te sequensen met behulp van een machine ter grootte van een smartphone die de MinION wordt genoemd. De doorbraak in miniaturisatie zou een meer gepersonaliseerde medische diagnose en beter onderzoek in het veld mogelijk maken.

De MinION is ontwikkeld door Oxford Nanopore Technologies en wordt momenteel getest om de technologie te evalueren. Door de kleine omvang en de relatief lage kosten konden wetenschappers veel geavanceerdere analyses uitvoeren buiten het laboratorium. "Het verbazingwekkende aan dit apparaat is dat het vele malen kleiner is dan een normale sequencer - je bevestigt het gewoon op een laptop via een USB-kabel", legt Jared Simpson uit, een hoofdauteur van het onderzoek.

"Het is verbazingwekkend", voegde Luiz Shozo Ozaki van het Center for the Study of Biological Complexity eraan toe, van plan om het handheld-apparaat te gebruiken om muggen te bestuderen die malaria en andere ziekten in de Amazone overbrengen. "Het is iets dat ik in mijn zak kan steken, in het regenwoud kan opnemen en daar een genetische sequentie kan krijgen."

Nauwkeurigheid

De tot nu toe geïdentificeerde nadelen draaien om nauwkeurigheid - de gegevens die het produceert zijn momenteel minder nauwkeurig dan de gegevens die door een grotere machine worden geproduceerd, wat betekent dat sterke bio-informaticagereedschappen nodig zijn om fouten te corrigeren. Dat was de focus van Simpson's paper: "We waren in staat om sequenties van nanoporiën wiskundig te modelleren en manieren te ontwikkelen om complete genomen van deze kleine sequencer te reconstrueren," zei hij.

Als het eenmaal is bewezen, hoopt het dat het apparaat kan worden gebruikt voor het sequencen van genomen van tumoren, wat de mogelijkheid biedt tot een meer gepersonaliseerde diagnose en behandeling voor kankerpatiënten. "Het is nog niet klaar voor prime time, maar het produceert veel gegevens", zegt Gregory Buck, ook van het Center for the Study of Biological Complexity. "We willen dat het werkt, en we zijn optimistisch dat het zal werken."

  • Komeet sonde Philae ontwaakt na zeven maanden slaap