Een paar maanden geleden schreven we over de MinION DNA-sequencer - een handheld-apparaat dat op een USB-poort van een computer kan worden aangesloten en in staat is DNA te sequencen. Destijds hoopte men dat het op veel wetenschappelijke gebieden nuttig zou kunnen zijn, maar zorgen over nauwkeurigheidstarieven.

Nu zijn die nauwkeurigheidsniveaus getest en de resultaten zien er veelbelovend uit. Sinds enkele maanden heeft haar maker, Oxford Nanopore, een "toegangsprogramma" uitgevoerd dat duizenden laboratoria over de hele wereld toegang heeft verleend tot de technologie en bijdraagt ​​aan de ontwikkeling ervan.

Om te zien hoe nauwkeurig het apparaat is, hebben vijf laboratoria in het Verenigd Koninkrijk, de VS, Canada en Nederland twee sets van tien experimenten uitgevoerd, allemaal volgens dezelfde instructies. Ze ontdekten dat de door MinION verzamelde gegevens consistent waren tussen de laboratoria en van goede kwaliteit, hoewel ze wel een paar tekortkomingen in de duidelijkheid van de software aan het licht brachten en hoe moleculen het apparaat passeren..

Kritieke problemen in uitdagende omgevingen

"Het apparaat presteert nu goed, met name voor virale en bacteriële genomen, dus je kunt het overal verzenden en weten dat je hetzelfde resultaat zult krijgen", zegt Mark Akeson, mede-uitvinder van de technologie die wordt gebruikt in het apparaat en de consultant naar Oxford Nanopore.

"We kijken naar een democratisering van de sequencing in de nabije toekomst. Dat is dingen veranderen voor mensen die kritieke problemen in uitdagende omgevingen moeten oplossen, zoals het volgen van Ebola-stammen tijdens de recente uitbraak in West-Afrika..

"Een andere uitdagende omgeving is ruimte - de MinION wordt de eerste DNA-sequencer die in de ruimte wordt getest door NASA op het internationale ruimtestation ISS."

Camilla Ip, die hielp bij het coördineren van de tests, voegde eraan toe: "Over een paar jaar kunnen mensen die verschillende stappen verwijderd zijn van fundamenteel genomisch onderzoek, zoals leraren in een klaslokaal, dit apparaat gebruiken om de wetenschap op nieuwe, opwindende manieren te onderwijzen. dat is nooit eerder mogelijk geweest.

"De kinderen die op het punt staan ​​naar de universiteit te gaan om zich bij het personeel aan te sluiten, zijn degenen die nieuwe smartphone-apps gaan maken die dit sensorapparaat gebruiken voor toepassingen die we nog niet hebben bedacht."

  • Deze 3D-geprinte robot tentakel is geïnspireerd op octopus spieren